国立新美术馆的概念是“森林中的美术馆”，设立的目的主要为举办展览会、展示收藏作品和普及美术教育的功能。馆内设有博物馆商店、餐厅、咖啡厅等设施，期望能成为容易亲近的美术馆。

位于东京六本木的国立新美术馆，其建筑是由黑川纪章设计，占地30,000平方米，楼地板面积为47,960平方米，为日本目前楼地板面积最大的美术馆。

美术馆是外观全部使用玻璃的建筑形式，并有栽种许多植物的庭园包围整栋建筑。在美术馆内，为了能同时进行多个公募展所需要的作品搬入、开箱、审查等作业，因此备有许多的卡车卸货平台、停车场、审查会场和审查员休息室等设施。

位于前庭的历史建筑，是保存了二二六兵变时的旧步兵第三连队兵舍的一部份。这栋建筑在二战后曾作为东京大学的生产技术研究所使用。在研究所搬迁至驹场校区后，原本预定要进行拆除。但在希望能保留历史建物的要求意见下，保存了一部份的建筑。

美术馆的标志是由许多红色线条组成的汉字“新”，由艺术指导佐藤可士和设计。